中國教育報-中國教育新聞網(wǎng)訊(記者 胡航宇)10月9日,西南大學發(fā)布最新科研成果,家蠶基因組生物學國家重點實驗室團隊歷時四年,完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析(“千蠶基因組”),繪就家蠶超級泛基因組圖譜。該研究在世界上率先實現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化,創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”,對于深化功能基因組研究和推進家蠶模式化,開啟家蠶設(shè)計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等,將產(chǎn)生深遠的影響。
家蠶是重要的經(jīng)濟昆蟲和新興模式生物,但之前僅有單一參考基因組及部分重測序,尚不足以支撐基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘。家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學家代方銀教授介紹,研究團隊對1078份蠶種質(zhì)資源(205份地方種,194份改良種,632份遺傳材料,47份野桑蠶)進行了深度測序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個蠶的高質(zhì)量基因組,對100個基因組進行了基因注釋,鑒定到4300余萬個SNP、930余萬個InDel、340余萬個結(jié)構(gòu)變異(SV)和7308個新基因(家族),繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。
該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息,是迄今全球動植物領(lǐng)域最大的長讀長泛基因組。同時,對蠶的各種遺傳變異、群體結(jié)構(gòu)、人工選擇和生態(tài)適應性及經(jīng)濟性狀開展了深入的研究,取得豐碩的創(chuàng)新結(jié)果。其研究論文于今年9月24日在國際名刊《自然通信》(Nature Communications)在線發(fā)表。
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